Данное исследование посвящено всестороннему изучению истории становления и развития молекулярно-биохимических методов, ставших краеугольным камнем современной филогенетики. Мы проследим путь от первых шагов в использовании биохимических данных для построения филогенетических деревьев до революционных достижений, связанных с секвенированием геномов и анализом нуклеотидных и аминокислотных последовательностей. Особое внимание будет уделено ключевым открытиям, выдающимся ученым и основным вехам, определившим вектор развития дисциплины, а также анализу широкого спектра применений этих методов в различных областях биологии, от систематики до изучения эволюции заболеваний. Рассматриваются как фундаментальные, так и прикладные аспекты.